Ученые впервые полностью собрали и аннотировали митохондриальный геном душицы обыкновенной (Origanum vulgare), известной как орегано. Эта работа расширяет базу геномных данных о растении.
С помощью технологии длиннопрочитного секвенирования исследователи составили карту митогенома размером 497,2 тыс. пар оснований и нанесли на нее 57 генов: 39 из них кодируют белки, 14 отвечают за транспортную РНК и четыре – за рибосомную РНК. Одновременно был собран и описан геном хлоропластов этого же вида.
Анализ последовательности показал, что митогеном душицы имеет сложную и вариативную структуру. В нем обнаружили многочисленные повторяющиеся участки – девять простых, 26 тандемных и 607 разбросанных по геному. Исследователи также вычислили 395 потенциальных участков редактирования РНК. Эти выводы – результат компьютерного моделирования, и их предстоит подтвердить экспериментально.
Чтобы определить эволюционное положение душицы, ее митохондриальные гены сравнили с генами 25 других видов растений. Анализ показал близкое родство с другими представителями порядка Ясноткоцветные (Lamiales). Ученые также предполагают, что в геноме растения происходили значительные перестройки в ходе адаптивной эволюции.
Работа опубликована в виде предварительной версии, которая еще может быть отредактирована. В ней нет данных об образцах растений и месте их сбора, что не позволяет в полной мере оценить выводы об эволюции. Функции расшифрованных генов пока не установлены, как и их возможная связь с лекарственными свойствами душицы, ее применением в биотехнологиях или селекции.