Учёные секвенировали транскриптом морозостойкого вечнозелёного бересклета (Euonymus japonicus) и на его основе создали набор генетических маркеров. Этот инструментарий позволит ускорить выведение новых сортов и поможет в изучении генетического разнообразия растений этого рода.
В качестве материала для исследования учёные использовали сорт «Beihaidao». После полноразмерного секвенирования транскриптома они получили более 220 тыс. полноценных генетических последовательностей. Дальнейший анализ и очистка данных позволили выделить свыше 50 тыс. уникальных транскриптов. В них обнаружили почти 37 тыс. участков, пригодных для разработки молекулярных маркеров.
На основе полученных данных исследователи разработали 200 пар маркеров. Из них отобрали 16 наиболее эффективных – тех, что давали чёткие и стабильные результаты при генетическом анализе. Эти маркеры успешно протестировали на 22 образцах зародышевой плазмы бересклета. Они оказались применимы не только для разных образцов одного вида, но и для родственных видов, что говорит о возможности их широкого использования в пределах всего рода.
Авторы исследования полагают, что полученные данные и разработанные маркеры станут основой для дальнейших работ в области генетики и селекции бересклета. Их можно будет применять для поиска генов, оценки генетического разнообразия популяций, а также для целенаправленного выведения сортов с заданными свойствами и сохранения генофонда. При этом в самой работе представлены лишь результаты разработки маркеров и их ограниченного тестирования, а не практические итоги их применения в селекции или природоохранных программах.