Греческие аборигенные породы овец резко разделились по состоянию генофонда: пока островные популяции сохраняют высокое разнообразие, часть материковых пород стремительно беднеет из-за малого поголовья и близкородственных скрещиваний. К такому выводу пришли ученые под руководством Спиридулы Георгату, составившие самую полную на сегодня геномную карту овцеводства Греции. Статью опубликовал научный журнал Genetics Selection Evolution.
Авторы собрали кровь у 778 овец, представляющих 36 греческих пород и локальных популяций. В выборку вошли 25 официально признанных пород, пять описанных в научной литературе и шесть ранее не изученных местных групп, которые исследователи нашли во время выездов к фермерам. Чтобы вписать греческий скот в общий эволюционный контекст, данные объединили с геномами 85 зарубежных пород и пяти видов диких баранов, включая снежного барана и муфлонов. Итоговая база охватила 127 популяций. Коммерческие тесты ДНК обычно настраивают под высокопродуктивный скот, поэтому они занижают генетическое разнообразие у местных пород. Чтобы избежать этой погрешности, специалисты проанализировали не только 46 733 одиночных маркера (SNP), но и 4347 гаплотипических блоков, объединяющих по четыре соседних участка ДНК.
По структуре генома греческие овцы занимают промежуточное место между породами Западной Европы и Юго-Западной Азии. Это объясняется историей региона: в эпоху неолита через территорию Греции домашний скот перегоняли из Плодородного полумесяца в Европу. При этом многие местные породы удержали богатый генофонд. Высокое разнообразие и низкий уровень инбридинга зафиксировали у пород лесбос, влахико и карагунико. Популяция с острова Лесбос сравнима по генетическому богатству с наиболее разнообразными породами Ближнего Востока, а ее эффективная численность (число животных, реально участвующих в размножении) в последних поколениях достигает 915 голов.
Породы фраки, агринио, катафигио, серрес и аргос, напротив, теряют генетическое разнообразие. Хуже всего дела обстоят у породы фраки: у нее оказалось меньше всего вариантов генов и самая высокая степень инбридинга. В целом у всех изученных групп эффективная численность поколение за поколением падала. В среднем по Греции за последние пять поколений она составила 210 особей – больше, чем на Балканах и в Италии, но меньше, чем в Азии и Западной Европе. Материковые породы вроде фраки и агринио стали настолько малочисленными, что могут легко утратить оставшиеся гены из-за случайного дрейфа.
Овцы с островов Крит, Касос и Карпатос выделились в замкнутый генетический кластер. Их естественную изоляцию в 1960-х годах закрепили ветеринарные правила: власти запретили перевозить скот между материком и островами, чтобы сдержать бруцеллез. На Крите тесное родство связывает породы астерусия, аногия и сфакия, а также стада с плато Ласити и из Ситии, причем сильнее всего на островное поголовье повлияла сфакия. В то же время греческие полужирнохвостые породы – хиос, лесбос и икария – оказались генетически близки к скоту Ближнего Востока и Северной Африки. Так, хиосская овца тесно связана с турецкой породой сакиз и кипрскими жирнохвостыми овцами, что подтверждает давний обмен племенным скотом вокруг Эгейского моря.
Особый профиль показала порода арта, сдвинувшаяся в сторону западноевропейских молочных овец. Это следствие селекции середины XX века: около 60 лет назад местных равнинных овец планомерно скрещивали с немецкой восточно-фризской породой. Исследователи отмечают, что в работе есть и пробелы: из-за малочисленности популяций родос, икария, ципурейка и румлуки удалось собрать слишком мало образцов, поэтому эти четыре группы пришлось исключить из части расчетов.
Полученная карта поможет властям и аграриям расставить приоритеты в селекции и охране скота. Породы с широким разнообразием, такие как лесбос и влахико, хранят ценные адаптивные гены, которые помогут средиземноморскому животноводству приспособиться к меняющемуся климату. Исчезающим породам – прежде всего фраки и агринио – срочно нужны племенные книги и целевые программы разведения. Авторы подчеркивают, что малым популяциям поможет контролируемый обмен производителями, но самобытные породы важно уберечь от бесконтрольного скрещивания.